iPhone OS 3.0 Software Update已於2009年6月18日開始提供iPhone和iPod touch客戶下載。凡是iPhone的現有客戶皆可免費更新，而iPod touch的客戶若要更新也只需支付美金$ 9.95的價格。iPhone OS 3.0 Software Update內含100多種新增功能。

iPhone 3.0的新增功能包括：可以在任何應用程式之間進行剪貼與拷貝資料；可透過MMS多媒體簡訊收發照片、聯絡人、音訊檔案與位置的Messages應用程式；新增橫向檢視的Mail、Text和備忘錄；能夠隨時隨地錄製和傳送音訊檔案的全新Voice Memos (語音備忘錄) 應用程式；立體聲Bluetooth；將備忘錄的資料同步到Mac和PC電腦上；搖一搖就隨機播放；電視節目分級保護控制；自動登入Wi-Fi熱點等等。iPhone OS 3.0也藉由Spotlight擴充了所有iPhone或iPod touch主要應用程式的搜尋能力，讓使用者能夠搜尋Mail、iPod和備忘錄當中的資料，或者在各主要應用程式之間執行搜尋，只要在首頁畫面開啟新的Spotlight，然後輸入一個關鍵字詞即可。

新版的股市應用程式可顯示公司最新消息以及即時交易資訊，如：開盤價、平均價格、交易量、市值，並且提供橫向檢視，讓使用者以全螢幕方式觀看任何股票的走勢圖。iPhone現在也具備CalDAV支援，使用者可以在iPhone上查看共用的行事曆，並且與iCal、Yahoo、Google與Oracle行事曆同步。

iPhone 3.0的重大功能摘要如下：

• 跨應用程式剪貼與拷貝資料。
• Mail、Messages、備忘錄和Safari提供橫向鍵盤。
• 收發含有視訊、相片、音訊與聯絡資訊的MMS多媒體簡訊。
• 可搜尋所有聯絡人、電子郵件、行事曆、備忘錄以及iPod上所有資料的Spotlight。
• MobileMe的Find My iPhone與Remote Wipe：找回您遺失的iPhone、用 Remote Wipe保護您的隱私。
• 功能更強的行事曆：透過Microsoft Exchange ActiveSync訂定會議，還可以藉著CalDAV支援功能來訂閱行事曆。
• 立體聲Bluetooth：接上相容的 Bluetooth 立體聲耳機、車用套件或其他配件。
• Internet共享：使用Internet共享功能，透過Bluetooth或USB將網路連線分享給您的筆記型電腦。
• 同步備忘錄：將您在iPhone上寫好的備忘錄同步到Mac或PC上。
• 支援更多語言：iPhone現在支援30種語言以及40多種鍵盤配置。新增印尼文與泰文支援。
  

除了iPhone 3.0 Software Update之外，使用者還有App Store上的50,000多種應用程式可供選購。